莆田市水产科学研究所关于转录组测序和miRNA测序询价招标公告

我所因开展课题工作的需要，拟委托具有高通量测序资质的单位：（略）
一、资质要求
具有GB/T（略）/（咨询申报：（略））ISO9001:2015的资质认证。
二、委托服务期限
委托合同生效且样本合格后，15个工作日内完成测序及质控分析，提供合格的质控报告后，以单宗计费方式：（略）
三、委托内容
在服务期内承担本项目的测序相关工作，包括60个样品转录组测序和40个样品的miRNA测序，服务包括样品RNA的提取、文库构建、库检、illuminaPE150测序6G，并按要求出具测序数据的质控报告以及流程分析结果，并能提供个性化分析服务；要求出具转录组和miRNA进行关联分析结题报告；要求转录组和miRNA（略）可进行线上操作分析。
分析内容需要涵盖：
1.数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理
2.比对分析：比对核糖体序列、参考基因组（或其他参考序列）
3.基因分析：
1)新基因鉴定
2)基因类型统计
3)基因覆盖度统计
4)测序饱和度分析
5)基因测序随机性分析
4.基因表达量统计（表达量计算，表达量丰度分布）
5.样本关系分析（基于表达量）
1)主成分分析（PCA）
2)相关性系数热图
6.组间差异分析
1)差异基因整体统计
2)差异比较火山图
3)差异基因聚类热图
4)差异基因GO富集分析
5)差异基因KEGG富集分析
6)差异基因DO富集分析
7)差异基因Reactome富集分析
7.（略）络分析（PPI分析）
1)String（略）络分析
2)网络图绘制
8.GSEA分析(GeneSetEnrichmentAnalysis)
9.趋势分析
10.InDel/SNP突变分析
11.基因可变剪切鉴定
12.内含子miRNA的reads分布
13.（略）潜在受miRNA调控的靶基因分布
14.miRNA-mRNA（略）络
1)两两比较组关联分析
2)差异表达分析
3)miRNA-靶基因对筛选
4)cytoscape分析
5)miRNA靶向能力分析
6)基因结合miRNA能力分析
7)miRNA靶基因功能富集分析
15.针对本项目提供转录组与miRNA关联分析，以及提供个性化分析服务支持
16.个性化分析包括根据材料与需求，协商确定定制化信息分析内容，协助至文章发表，对于文章投递过程中补充数据分析，能按要求进行数据分析并及时提供分析结果，对审稿人的疑问及时进行解答。
四、最高限价
本次招标费用最高限价为（略）。
五、评定办法
1.按照服务报价最低价中标原则确定受委托单位：（略）
2.请有意向单位：（略）
联系人：（略）
传真：（略）邮箱：（略）
单位：（略）
单位：（略）
邮政编码：351100